Bilgi- kayıt sistemi oldukça sıkıntılı olan KOÜ’de hiçbir uyarı yapılmadan 218 öğrencinin okuldan atıldığı iddia edildi. Şubat 2016 yılında kayıt yaptıran öğrenciler 2015 yılında çıkan yönetmeliğe tabii tutularak İnşaat Mühendisliği Yüksek Lisans programına başladı. Ekim 2016 yılında çıkan ve 2017 yılında kayıt olan öğrencileri kapsayan yönetmeliğe göre, kredili derslerini ve seminer derslerini başarı ile tamamlayamayan öğrenciler okulla ilişiğinin kesileceği  maddeler halinde yazılıydı. Ancak 2016 Şubat ayında okula kayıt olan 218 öğrencinin bu yönetmelik yüzünden okuldan atıldığı iddia edildi.

Okuldan atılan öğrenciler birçok sınavda ve projede başarılı olduklarını ifade ederek bir an önce bu durumun çözülmesini talep ediyor.